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An example of cooperation between scientist and managers : The Meditearranean Lagoon Network (Languedoc-Roussillon, France) ArchiMer
Laugier, Thierry; Malet, Nathalie; Munaron, Dominique; Derolez, Valerie; Fiandrino, Annie; Barral, Marc; Moragues, Laurent; Mazouni, Nabila; Graille, Chantal.
The poster presents the approach that led to the construction of a network of cooperation between managers and scientists for coastal lagoon management in the region of Languedoc-Roussillon, its architecture and modus operandi, its achievements and developments over time. At the end of the ninety’s, eutrophication and lack of knowledge were identified as issues to enhance the management of coastal lagoons on the Mediterranean coast of France. In 2000, in the region of Languedoc-Roussillon, scientists (Ifremer) and institutional managers (Regional Council of Languedoc-Roussillon and Water Agency Rhône-Méditerranée & Corse) joined their forces in building a network to address this need. The core of this network consists of an operational tool for the...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11343/8101.pdf
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Assessment of eutrophication of French Mediterranean lagoons in relation to meteorological interannual variability ArchiMer
Malet, Nathalie; Derolez, Valerie; Laugier, Thierry; Munaron, Dominique; Fiandrino, Annie; Messiaen, Gregory; Fortune, Martine; Souchu, Philippe; Barral, Marc; Daloz, Aurélien; Moragues, Laurent.
Since recent decades, nutrient-related eutrophication, originating from agricultural use of fertilizer and population enhancement, can be considered worldwide as the main disturbance for coastal lagoons. Since coastal lagoons are very shallow and enclosed, their functioning is tightly linked to meteorological conditions. The aim of this study is to compare different rainfall levels and eutrophication response on coastal lagoons of the Languedoc-Roussillon (Western Mediterranean coast), subject to different nutrient loads from their watershed, in order to check the possibility to distinguish the effects of watershed management or rainfall conditions on water quality (waste water treatment plant improvement, decrease of fertilizer spreading).
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00008/11945/8651.pdf
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Caractérisation des facteurs de risques associés au mortalités estivales - Synthèse du thème 3 - Risque associé au stress environnemental - 2002-2005 ArchiMer
Burgeot, Thierry; Gagnaire, Beatrice; Renault, Tristan; Haure, Joel; Moraga, D.; David, E.; Boutet, L.; Sauriau, P.g.; Malet, Nathalie; Bouchet, V.; Lapegue, Sylvie; Bouilly, Karine; Le Moullac, Gilles; Arzul, Genevieve; Knoery, Joel; Quiniou, Francoise; Bacher, Cedric; Soletchnik, Patrick.
Les mortalités d'huîtres observées sur les côtes françaises apparaissent principalement à proximité du sédiment et pendant la gamétogenèse. Les interactions de facteurs environnementaux sur les écosystèmes conchylicoles comme la température, les apports des bassins versants et le compartiment sédimentaire illustrent un risque de mortalité lié à différentes sources de stress (Thème 1). Les variations de la qualité de la ressource trophique pendant l'effort de gamétogenèse favorise une baisse de l'énergie disponible (Thème 2) et contraint l'organisme fragilisé à fournir un effort d'adaptation (Fent 2004). L'apparition d'un stress pendant cette période sensible des huîtres pourrait constituer un facteur aggravant de mortalité. L'objectif de cette étude est...
Tipo: Text
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41538/40746.pdf
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Changement climatique et données météorologiques infra-régionales en méditerranée occidentale. ArchiMer
Colmet-daage, Raphael; Malet, Nathalie; Dufresne, Christiane.
Traitement de données climatiques afin de définir des types de microclimats et d’en suivre l’évolution au cours des ans, en comparaison avec les microrégions voisines. Cette note n’a pas pour vocation de présenter une étude climatologique détaillée, ou encore des traitements statistiques poussés. Elle a pour objectif de permettre la caractérisation générale et comparative des différents contextes hydro-climatiques des sous-régions et des microrégions nécessaires à la compréhension du fonctionnement écologique de différents milieux de transition en cours d’étude. Il en ressort une méthodologie transposable à toutes micro-régions méditerranéennes et un panel de graphiques.
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57303/63363.pdf
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Cinétique d'acquisition du terroir Marennes-Oléron par l'huître creuse Crassostrea gigas : approche par les isotopes stables ArchiMer
Malet, Nathalie; Sauriau, Pierre-guy; Haure, Joel.
Japanese oysters previously reared in controlled conditions were replaced into the Marennes Oléron Bay on intertidal oyster parks during 2002 summertime. Kinetics of carbon and nitrogen isotope ratios was followed in 5 organs (digestive gland, gills, mantle, muscle and gonads). Results confirmed excepted significant differences in isotopie signatures between organs and revealed differences in the time required reaching equilibrium with the isotopie signatures of local food sources.
Tipo: Text Palavras-chave: Cinétique; Isotopes stables; Bassin de Marennes Oléron; Crassostrea gigas.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-6526.pdf
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Complementarity of the multidimensional functional and the taxonomic approaches to study phytoplankton communities in three Mediterranean coastal lagoons of different trophic status ArchiMer
Leruste, A.; Villeger, S.; Malet, Nathalie; De Wit, R.; Bec, B..
We used the individual-based multidimensional functional diversity and the taxonomic approaches in a complementary way to describe phytoplankton communities in three coastal lagoons with different eutrophication status in the South of France. We sampled communities during three seasons, i.e., in autumn, spring, and summer. Using classical taxonomy, 107 taxa/morphotypes were identified in the nine communities. The individual-based functional approach allowed grouping these individuals into 20 functional entities according to their values for 5 traits related to trophic adaptations (cell size, mobility, trophic regime, coloniality, and pelagic/benthic life). Some species (e.g., Prorocentrum micans) emerged in multiple functional entities, showing the...
Tipo: Text Palavras-chave: Classification; Functional entity; Functional traits; Taxonomic diversity.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54454/55826.pdf
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Dynamics and sources of suspended particulate organic matter in the Marennes-Oléron oyster farming bay: Insights from stable isotopes and microalgae ecology ArchiMer
Malet, Nathalie; Sauriau, Pierre-guy; Ryckaert, Mireille; Malestroit, Pascale; Guillou, Gael.
The aim of this study was to distinguish between sources of the complex variety of Marennes-Oléron Bay suspended particulate organic matter (SPOM) contributing to the tropho-dynamics of the Marennes-Oléron oyster farming bay. Basic biomarkers (Chl a, C/N and POC/Chl a ratios), carbon and nitrogen stable isotopes from SPOM were analyzed and the microalgae community was characterized. The sampling strategy was bimonthly from March 2002 to December 2003; samples were taken from an intertidal mudflat. Four main sources contributed to the SPOM pool: terrigenous input from rivers, neritic phytoplankton, resuspended microphytobenthos and periodic inputs from intertidal Zostera noltii meadows. Seasonal fluctuations were observed in both years of the study period:...
Tipo: Text Palavras-chave: Heatwave; Zostera noltii; Mudflat; Microphytobenthos; Phytoplankton; Suspended particulate organic matter; Marennes Oléron Bay.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4313.pdf
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Ecologie alimentaire de l'huitre Crassostrea gigas : dynamiques des compositions isotopiques naturelles ArchiMer
Malet, Nathalie.
Trophic transfers of particulate organic matter sources to the Pacific oyster Crassostrea gigas were investigated in the oyster farming bay of Marennes-Oléron for two years. Stable isotope ratios of carbon and nitrogen were used to trace the origin and fate of primary production and organic matter inputs into the bay, and to depict trophic transfers to oysters that were experimentally reared according to traditional methods. Characterizing particulate organic matter sources available for oysters utilized a combination of hydrobiological parameters and stable isotope ratios. Processes of food incorporation by oysters were described for five organs such as gills, digestive gland, mantle, muscle and gonads, and were interpreted taking into account...
Tipo: Text Palavras-chave: Microphytobenthos; Phytoplankton; Organs; Trophic discrimination; Tissue turnovers; Particulate organic matter; Marennes Oléron Bay; Pertuis Charentais; Stable isotopes; Pacific oysters; Crassostrea gigas; Microphytobenthos; Phytoplancton; Hydrologie; Organes; Enrichissement trophique; Renouvellement tissulaire; Matière organique particulaire; Bassin de Marennes Oléron; Pertuis Charentais; Isotopes stables; Crassostrea gigas; Huître creuse.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-2089.pdf
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Effect of seasonal variation in trophic conditions and the gametogenic cycle on d13C and d15N levels of diploid and triploid Pacific oysters Crassostrea gigas ArchiMer
Malet, Nathalie; Sauriau, Pierre-guy; Faury, Nicole; Soletchnik, Patrick; Guillou, Gael.
Carbon and nitrogen stable isotopes were investigated in separate organs of diploid and sterile triploid Pacific oysters Crassostrea gigas for 13 mo, together with changes in chemical and isotope composition of suspended matter sampled from an intertidal mudflat within Marennes-Oléron Bay, France. Particulate organic matter (POM) was a mixture of pelagic and benthic material with a predominance of neritic phytoplankton in spring, and resuspended microphytobenthos in summer and autumn. A remarkable shift of +30/00 in d13C was reflected in both diploids and triploids from spring to summer, and further temporal differences were observed amongst their tissues. Seasonal changes in POM d15N were also reflected in oyster tissues, with digestive gland and muscle...
Tipo: Text
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2828.pdf
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Estimation des échanges entre la mer et la lagune de Biguglia : Utilisation de la méthode d’estimation des volumes d’eau échangés entre la mer et les lagunes par différence de hauteurs d’eau. ArchiMer
Tunin-ley, Alina; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie; Orsoni, Valerie; Baldi, Yoann.
Le projet a pour objectif premier de disposer d'un modèle hydrodynamique opérationnel (modèle MARS) sur la lagune de Biguglia et de le valider sur la base de paramètres mesurés in situ (hauteurs d'eau, salinité, température, débits échangés avec la mer). Cela permettra ensuite de caractériser le fonctionnement physique de la lagune à l'aide de descripteurs hydrodynamiques (influence relative des différents forçages, temps de résidences...) puis d'en dégager une typologie saisonnière. Cette étude préliminaire a pour but d’estimer les volumes journaliers entrants et sortants à partir des données de hauteurs d’eau de part et d’autre des graus. Cette étude a été menée sur la lagune de Biguglia grâce à la méthode développée au LER-LR sur différents étangs du...
Tipo: Text Palavras-chave: Echanges mer/lagune; Hauteur d’eau; Grau; Hydrodynamique; Biguglia (lagune Corse).
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00214/32525/31011.pdf
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Evaluation of FluoroProbe® performance for the phytoplankton-based assessment of the ecological status of Mediterranean coastal lagoons ArchiMer
Garrido, Marie; Cecchi, Philippe; Malet, Nathalie; Bec, Beatrice; Torre, Franck; Pasqualini, Vanina.
The European Water Framework Directive and several other legislations worldwide have selected phytoplankton for monitoring the ecological status of surface waters. This assessment is a complicated task in coastal lagoons due to their intrinsic variability, prompting moves to use real-time measurements. Here, we tested the ability of the submersible spectrofluorometer FluoroProbe® to accurately estimate the phytoplankton biomass and to efficiently discriminate spectral groups in Mediterranean coastal lagoons, by using sub-surface water samples (n = 107) collected at Biguglia lagoon (Corsica) in different environmental situations (salinity and trophic state) from March 2012 to December 2014. We compared the estimates of biomass and phytoplankton group...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplankton; Monitoring; Mediterranean coastal lagoons; FluoroProbe (R); HPLC.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00484/59582/62623.pdf
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Fifty years of ecological changes: Regime shifts and drivers in a coastal Mediterranean lagoon during oligotrophication ArchiMer
Derolez, Valerie; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie; Lagarde, Franck; Richard, Marion; Ouisse, Vincent; Bec, Beatrice; Aliaume, Catherine.
Thau lagoon is a large Mediterranean coastal lagoons and it supports traditional shellfish farming activities. It has been subject to eutrophication leading to major anoxic events associated with massive mortalities of shellfish stocks. Since the 1970s, improvements have been made to wastewater treatment systems, which have gradually led to oligotrophication of the lagoon. The aim of our study was to determine how the decrease in nutrient inputs resulted in major ecological changes in Thau lagoon, by analysing five decades of time-series (1970–2018) of observations on pelagic and benthic autotrophic communities. We were able to identify two periods during the oligotrophication process. Period 1 (1970–1992) was considered a eutrophic period, characterised...
Tipo: Text
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00629/74068/73521.pdf
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First steps of ecological restoration in Mediterranean lagoons: Shifts in phytoplankton communities ArchiMer
Leruste, A.; Malet, Nathalie; Munaron, Dominique; Derolez, Valerie; Hatey, E.; Collos, Y.; De Wit, R.; Bec, B..
Along the French Mediterranean coast, a complex of eight lagoons underwent intensive eutrophication over four decades, mainly related to nutrient over-enrichment from continuous sewage discharges. The lagoon complex displayed a wide trophic gradient from mesotrophy to hypertrophy and primary production was dominated by phytoplankton communities. In 2005, the implementation of an 11 km offshore outfall system diverted the treated sewage effluents leading to a drastic reduction of anthropogenic inputs of nitrogen and phosphorus into the lagoons. Time series data have been examined from 2000 to 2013 for physical, chemical and biological (phytoplankton) variables of the water column during the summer period. Since 2006, total nitrogen and phosphorus...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplankton; Coastal lagoons; Nutrient; Sewage effluents; Re-oligotrophication.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00346/45701/45324.pdf
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Flux d’eau et de nutriments extrapolation mensuelle et saisonnière. Etude réalisée sur la lagune de Biguglia et l’estuaire de Fiume Santu (Haute-Corse) ArchiMer
Colmet-daage, Raphael; Malet, Nathalie.
Les écosystèmes côtiers marins sont parmi les plus productifs au monde et jouent un rôle essentiel dans le cycle de la matière. Ces écosystèmes ont en effet une très forte capacité d'exportation de matière, de ressources trophiques et d'organismes. Ces milieux sont en particulier fortement influencés par les variations des conditions hydro-climatiques environnantes. C’est avec l’objectif de mieux comprendre le fonctionnement écologique de ces milieux de transition que la présente étude a été réalisée. L’objectif de cette étude est d’une part de mettre en place une méthodologie de mesure et de calcul des flux d’eau et de nutriments au sein de ces milieux de transition en Haute-Corse, et d’autre part d’extrapoler les résultats horaires à des simulations...
Tipo: Text Palavras-chave: Flux d’eau et de nutriments; Nutriments; Lagune; Estuaire méditerranéen; Debit; Milieu de transition.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00489/60075/63397.pdf
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Fonctionnement écosystémique de la lagune de Biguglia. Partie 2 : Déploiement du modèle écosystémique GAMELag sur la lagune de Biguglia ArchiMer
Pete, Romain; Fiandrino, Annie; Malet, Nathalie.
Afin d’apporter des éléments de réponse quantitatifs à ces questions, un outil numérique GAMELag a été développé en collaboration avec l’UMR ECOSYM en se basant sur l’approche LOICZ. Par suite ce modèle « simple » (modèle en boîtes avec calcul de bilan de matière aux interfaces) a été affiné au cours de phases successives de validation. La présente étude vise à déployer le modèle écosystémique « GAMELag » permettant d’évaluer les flux et stock d’azote et de phosphore dans la lagune de Biguglia. L’objectif est de i) valider le fonctionnement du modèle sur la lagune de Biguglia et ii) de fournir aux gestionnaires des résultats en réponse à différents scenarios hydroclimatiques (année sèche/pluvieuse) ou selon différentes options de gestion, notamment...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle écosystémique; GAMELag; Flux; Stock; Azote; Phosphore; Scenarios écologiques.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00604/71564/70011.pdf
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Fonctionnement écosystémique de la lagune de Biguglia. Partie 3 : Scénarios écologiques ArchiMer
Pete, Romain; Malet, Nathalie.
Afin d’apporter des éléments de réponse quantitatifs à ces questions, un outil numérique GAMELag a été développé en collaboration avec l’UMR ECOSYM en se basant sur l’approche LOICZ. Par suite ce modèle « simple » (modèle en boîtes avec calcul de bilan de matière aux interfaces) a été affiné au cours de phases successives de validation. La présente étude vise à déployer le modèle écosystémique « GAMELag » permettant d’évaluer les flux et stock d’azote et de phosphore dans la lagune de Biguglia. L’objectif est de i) valider le fonctionnement du modèle sur la lagune de Biguglia et ii) de fournir aux gestionnaires des résultats en réponse à différents scenarios hydroclimatiques (année sèche/pluvieuse) ou selon différentes options de gestion, notamment...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle écosystémique; GAMELag; Flux; Stock; Azote; Phosphore; Scenarios écologiques.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00604/71565/70025.pdf
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Fonctionnement hydrodynamique de la lagune de Biguglia. Partie 1 : Mise en place de la modélisation numérique 3D ArchiMer
Dufresne, Christiane; Malet, Nathalie; Coudray, Sylvain; Fiandrino, Annie.
Le projet Interreg Retralags vise une gestion durable du patrimoine des lagunes, des lacs et des étangs et est développée afin de protéger et de valoriser le patrimoine écosystémique. Cette gestion intégrée s’appuie notamment sur des modèles de gestion des zones humides, qui permettent d’une part d’améliorer notre compréhension de leur fonctionnement et d’autre part, de tester des hypothèses par la simulation de scénarii. Les deux actions IFREMER sont : - La mise en place du modèle hydrodynamique de la lagune de Biguglia, développement d’indicateur hydrologiques opérationnels et test de scenarii hydrologiques et climatiques - La mise en place du modèle écosystémique sur la lagune de Biguglia, développement d’indicateur écologiques opérationnels et test de...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle hydrodynamique; MARS3D; Lagune; Biguglia.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54453/55824.pdf
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Fonctionnement hydrodynamique de la lagune de Biguglia. Partie 2 : Fonctionnement hydrologique et hydrodynamique ArchiMer
Dufresne, Christiane; Malet, Nathalie.
Le projet Interreg Retralags vise une gestion durable du patrimoine des lagunes, des lacs et des étangs et est développée afin de protéger et de valoriser le patrimoine écosystémique. Cette gestion intégrée s’appuie notamment sur des modèles de gestion des zones humides, qui permettent d’une part d’améliorer notre compréhension de leur fonctionnement et d’autre part, de tester des hypothèses par la simulation de scénarios. Les deux actions IFREMER sont : - Action 1 : Mise en place du modèle hydrodynamique de la lagune de Biguglia, développement d’indicateur hydrologiques opérationnels et test de scenarii hydrologiques et climatiques - Action 2 : Mise en place du modèle écosystémique sur la lagune de Biguglia, développement d’indicateur écologiques...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle hydrodynamique; MARS3D; Lagune; Biguglia; Indicateurs et scenarii hydro-climatiques.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57300/59680.pdf
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Fonctionnement hydrodynamique de la lagune de Biguglia. Partie 3 : Indicateurs et test de scenario hydro-climatiques ArchiMer
Dufresne, Christiane; Fiandrino, Annie; Malet, Nathalie.
       
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle hydrodynamique; MARS3D; Lagune; Biguglia; Indicateurs hydrodynamiques.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57302/68421.pdf
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Guide to macrophytes in Languedoc-Roussillon lagoons: identification and monitoring (Poster) ArchiMer
Oheix, Jocelyne; Lauret, Michel; Derolez, Valerie; Malet, Nathalie; Laugier, Thierry.
Guide de reconnaissance et de suivi des principales espèces de macrophytes dans les lagunes du Languedoc-Roussillon. Les lagunes du Languedoc-Roussillon sont étudiées depuis plusieurs années par le laboratoire Ifremer de Sète dans le cadre du RSL (Réseau de Suivi Lagunaire; http://rsl.cepralmar.com). Plusieurs compartiments (chimique et biologique) sont suivis pour étudier la principale pression qui s’exerce sur les lagunes : l’eutrophisation. Les peuplements de macrophytes présents dans les lagunes sont un bon indicateur de la qualité du milieu vis à vis de l’eutrophisation. Une méthode de suivi par les macrophytes est développée, qui nécessite la reconnaissance des espèces. Le guide de reconnaissance des macrophytes, destiné aux techniciens et aux...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12666/9556.pdf
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